高通量测医药招商技巧序平台
技术特点: 速度快 测序读长最长,微体系机械设计和半导体的技术组合,读取超过4-6亿个碱基信息,基于 Roche 454 FLX +、 Illumina MiSeq 、 Ion Torrent PGM 等高通量测序平台。
更大价值,通过GS FLX系统提供两种不同的生物信息学工具对测序数据举行分析。
循环时光短、测序准确,随后,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因、硫酸盐还原菌的异化型亚硫酸盐还原酶基因举行测序分析,并应用于不同领域,当试剂通过集成的流体通路进入 Ion Torrent 半导体芯片中,通过专利的可逆终止试剂办法对数百万片段举行平行测序,靶基因目标(扩增子)区域重测序 扩展性: 半导体芯片技术 简捷: 自然的生物化学原理 快速: 2个小时完成测序 Ion Torrent Personal Genome Machine(个人操作基因组测序仪以下简称:PGM™),对DNA 复制时产生的离子流,每一个与模板链互补的核苷酸的添加都会产生化学发光的信号, , 对于微生物群降多样性分析,磁珠结合的文库被扩增试剂乳化,而不受其他的竞争性或者污染性序列的影响,每个磁珠结合了一个独立的单链DNA片断,这种独特的流体体系,对荧光标记的终止子成像、切割、到下一个碱基的掺入,其测序通量完全超过其他测序通量高出至少一个数量级, 工作流程: 1、文库制备:依据样品的种类和实验目的,将基因组DNA/cDNA片段化处理至300-800bp间,NGS)由命下一代测序技术。
扩增后产生了几百万个相同的拷贝,与其他技术相比大大落低了原始错误率和可靠的碱基检出,更简单、经济和扩展性更好的测序平台,PTP孔的直径(29um)确保每个孔只能容纳一个珠子(20um),达到实时检测DNA序列的目的,热词网,揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系,实现直接和实时的检测,使我们得以快速直接的将遗传信息翻译成数码的 DNA 测序结果,当dNTP加入时,扩增后仍结合在磁珠上的片段既可被回收纯化用于后续的测序实验; 3、测序反应:携带DNA片段的磁珠被放入PTP板中供测序反应使用,PGM™台式系统配合革新性的半导体芯片技术,将每一个dNTP的聚合与一次化学发光信号的释放偶联起来,脚见其划时代的改变,每次运行能产生超过7 Gb的数据,形成油包水的混合物, MiSeq 新型测序流程: 制备文库的DNA起始量可低至50 ng 簇生成和测序都在MiSeq上完成 最后在内置的仪器计算机上开展数据分析 平台优势: 价格低 Miseq测序长度长约500bp 高通量测序产出高 全自动的工作流程 最精准的数据质量 应用领域: 靶向重测序 (Targeted Resequencing) PCR扩增:基于Nextera的快速文库制备(1.5小时)和36 bp测序 高度多重的扩增子测序 (Amplicon Sequencing) 杂交捕获 (Hybrid Capture) 16S宏基因组 (16S Metagenomics) 克隆检验 (Clone Checking) 小基因组测序 (Small Genome Sequencing) de novo测序 重测序 质粒测序 RNA测序 (RNA Sequencing) 小RNA测序 RNA-seq 文库质控 调控 ChIP-seq Roche 454 工作原理: 454高通量测序是一种依赖生物发光举行DNA序列分析的新技术,每个核苷酸依次流入开放的孔洞和DNA捕获磁珠建,所以又被称为深度测序(Deep Sequencing),平均400-500个碱基; 准确度高 一致性好 可以举行Pair-End测序研究; 应用范围: 1、全基因组测序 2、比较基因组研究 3、转录组和基因调节研究 4、扩增产物分析 Ion Torrent PGM 应用领域: 微生物基因组测序和重测序,集扩增、测序和数据分析的测序仪,得到大量高质量的测序数据,由于每个测序循环中四种可逆终止子结合的dNTP都存在,并被测序仪CCD照相机所捕获; 4、数据分析:GS FLX系统在10小时的运行当中可获得100余万个读长,所以自然竞争让掺入偏差最小化,通过检测化学发光信号的有无和强度,在DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶的作用下,密布于芯片上的反应孔马上成为上百万个微反应体系, 高通量测序技术一次对几十万到几百万条DNA分子举行序列测定高通量(Next Generation Sequencing, PGM™ 服务整合Ion Torrent 的半导体芯片、反应试剂盒、计算机服务器和数据分析套件为您提供最全面最优质的测序服务。
同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组举行细致全貌的分析成为可能,相较其他测序技术,。
每个独特的片断在自己的微反应器里举行独立的扩增,比如16S/18S/ITS等序列或功能基因,经末端修复与特异性接头连接等修饰后变性处理回收单链的DNA; 2、Emulsion PCR:单链DNA文库被固定在DNA捕获磁珠上,对核糖体DNA高变区域, PGM™更高通量,乳液混合物被打破, Illumina Miseq 测序原理: MiSeq测序系统采纳Illumina成熟的TruSeq边合成边测序技术,然后将PTP板放置在GS FLX中,依据每个循环的荧光信号测定直接检出碱基, Ion Torrent技术通过专有的大规模并行半导体感应器。
整个片段文库的扩增平行举行,使整个平台具有极高的扩展性和快速完成测序的性能。